Am 09.01.1861, nahm die Volksversammlung von Mississippi die Anordnung zur Sezession an. Mit der Verkündung der Verordnung wurde eine große blaue Flagge mit einem einzelnen weißen Stern auf dem Capitol in Jackson gehisst. Einer der Anwesenden bei dieser Veranstaltung, ein irischstämmiger Schauspieler namens Harry Macarthy war von der Zeremonie so begeistert dass er ein Lied schrieb, welches "The Bonnie Blue Flag" hieß, welches später das zweitbekannteste patriotische Lied in der Konföderation wurde.
Die erste nachgewiesenen Verwendung der "Lone Star Flag" geht auf das Jahr 1810 zurück. Zu dieser Zeit war der östlich des Mississippi gelegene Landesteil von Louisiana, entlang der Südgrenzen von Mississippi und Alabama, die spanische Provinz West Florida. Dieses Gebiet war einst Teil von Französisch-Louisiana. Im Jahre 1763, nach dem Französischen und Indischen Krieg, trat Frankreich New Orleans und alles Gebiet von Louisiana westlich des Flusses an Spanien ab. Der Teil von Louisiana östlich des Flusses wurde an Großbritannien abgetreten, welches dieses Gebiet Westflorida nannte. Westflorida wurde von Spanien wärend seiner Feldzüge als Amerikanischer Verbündeter in den Revolutionskriegen erobert. Als Frankreich später Louisiana von Spanien zurückerwarb, gab es einige Meinungsverschiedenheiten, ob dabei Westflorida inbegriffen sei oder nicht. Spanien weigerte sich die Kontrolle über die Provinz aufzugeben, und die Vereinigten Staaten traten in die Meinungsverschiedenheiten ein, als sie Louisiana im Jahre 1803 von Frankreich kauften.
Die Einwohner von Westflorida waren zum größten Teil englischsprachige Menschen, welchen die autoritäre Herrschaft der Spanier nicht eben gut tat. Sie waren enttäuscht vom Versagen der Vereinigten Staaten das Territorium zu annektieren, und im Jahre 1804 kam es zu einer vergeblichen Revolte, welche von den Brüdern Reuben, Nathan und Sam Kemper angeführt wurde. In den Jahren nach dem Kemper-Aufstand, versuchten die englischsprachigen Einwohner Westfloridas einen gewissen Grad traditioneller Englischer Rechte innerhalb ihrer Spanischen Verwaltung zu bewahren. Dieses gipfelte in einer Volkstagung, welche sich im Jahre 1810 versammelte, um für einige Formen verfassungsmäßiger Garantien Druck zu machen.
Gouverneur de Lassus täuschte vor mit der Versammlung zusammen zu arbeiten, während er zum Gouverneur von Ostflorida sandte, um Truppen für das Zurückschlagen dieser Bedrohung seiner Autorität zu erhalten. Von der Doppelzüngigkeit des Gouverneurs erfahrend, gingen die Anhänger der Versammlung zur offenen Rebellion über. Am Sonnabend, dem 11. September 1810, besetzte ein Trupp Dragoner unter dem Kommando von Major Isaac Johnson das Provinz-Capitol in Baton Rouge. An der Spitze der Kolonne ritt ein Fähnrich mit einer blauen Flagge mit einem einzelnen, fünfzackigen, weißen Stern darin. Diese Flagge wurde einige Tage zuvor von Frau Melissa Johnson angefertigt. Zusammen mit anderen republikanischen Kräften unter dem Kommando von Oberst Philemon Thomas besetzten diese Männer Baton Rouge ohne eigene Verluste, nahmen Gouverneur de Lassus gefangen, und hissten am 23. September 1810 ihre "Bonnie-Blue-Flagge" auf dem Fort von Baton Rouge. Drei Tage später unterzeichnete John Rhea, Präsident der Westflorida-Versammlung, eine Unabhängigkeitserklärung, und die Flagge mit dem einzelnen Stern wurde zum Emblem einer neuen Republik.
Die Republik Westflorida war nur von kurzer Dauer. Da die spanische Herrschaft vom Lande genommen worden war, ohne den Gebrauch amerikanischer Truppen und ohne eigens Risiko, war die US-amerikanische Regierung daran interessiert ihren Anspruch auf Westflorida anzumelden. Am 27. Oktober 1810 erließ Präsident James Madison eine Erklärung welche Westflorida unter die Zuständigkeit des Gouverneurs des Louisiana-Territoriums deklarierte. Am 10. Dezember 1810, ersetzte die Flagge der Vereinigten Staaten die "Bonnie-Blue-Flagge" über Baton Rouge, und die Republik Westflorida war Geschichte.
Die Erinnerung an die Westflorida-Bewegung lebte in der Tradition des Südens weiter. Neunundzwanzig Jahre später nahm die Republik Texas eine ähnliche Nationalflagge an, nur wurde der weiße Stern durch einen gelben ersetzt. Zweiundzwanzig Jahre später wurde für einige Wochen des Jahres 1861 die "Lone-Star-Flagge" von Westflorida als die inoffizielle Flagge der Republik Mississippi verwendet; und Harry Macarthys Lied grub sie tief in die romantische Überlieferung des Südens ein. Als das Lied das erste mal in New Orleans vor einem gemischten Publikum von Texanern und Louisianern gespielt wurde, wurde es mit einem solchen Ausbruch von Zustimmung aufgenommen, der fast frenetische Züge trug. Die Flagge selbst war Hauptinhalt von Macarthys Lied. Sie war nicht länger als Sezessionsflagge in Gebrauch und wurde von Flaggen mit Palmenmotiven und Flaggen mit einzelnen Sternen, in anderen Farben als weißer Stern und blaues Feld, überschattet. Sie wurde von der Konföderierten Regierung nie übernommen, obwohl Mississippi am 26. Januar 1861 eine amtliche Flagge annahm, welche die "Bonnie-Blue-Flagge" in der Oberecke enthielt. Aber als ein Ergebnis von Macarthys Lied breitete sich die "Bonnie-Blue-Flagge" über die Konföderierte Nation und in den Herzen der Menschen aus.