Die Flagge von Manitoba wurde am 12.05.1966 angenommen. Sie orientiert sich am britschen Ensign-System. Dieses und die Verwendung des Union Jack weißt auf die Verbindung zu Großbritannien hin. Großbritannien hatte in Jahr 1864 ein Flaggensystem eingeführt, in dem: • Kriegsschiffe einen sogenannten "White Ensign" (Marineflagge), eine weiße Flagge oft mit durchgehendem roten Georgskreuz und mit dem Union Jack in der Oberecke, • Handelsschiffe einen "Red Ensign" (auch "Civil Ensign" → Bürgerflagge genannt, die eigentl. Handelsflagge), eine rote Flagge mit dem Union Jack in der Oberecke, und • Dienstschiffe einen "Blue Ensign" (Regierungsflagge → die eigentl. Staatsflagge), eine blaue Flagge mit dem Union Jack in der Oberecke führten. Seit 1865 durften Schiffe von Kolonialregierungen einen Blue Ensign mit einem Badge (Abzeichen) im fliegenden Ende führen. Die jeweiligen Regierungen sollten entsprechene Bagdes zur Verfügung stellen. Handelsschiffe und seefahrende Privatpersonen aus Kolonien dürfen nur dann einen Red Ensign mit Badge führen, wenn von der britischen Admiralität eine entsprechende Erlaubnis für die Kolonie erteilt wurde. Ein solches Badge war oft eine auf einer Scheibe platzierte regionale landschaftliche Darstellung, zeigte oft Schiffe, historische Begebenheiten oder konnte auch nur eine Art Logo sein. Sehr oft zeigte ein Badge zusätzlich den Namen des Landes oder auch einen Wahlspruch. Einige Besitzungen hatten aber auch schon von Anfang an ein Wappen, bzw. erhielten über die Jahre eine eigenes Wappen und das Badge wurde abgeschafft. Um ein weitgehend einheitliches Erscheinungsbild im fliegenden Ende der Flaggen zu gewährleisten, wurden Wappen und auch andere Symbole auf einer weißen Scheibe in der Größe der früheren Badges dargestellt. Es gab hier aber auch Ausnahmen, denn einige Kolonien verwendeten diese weiße Scheibe nicht, und platzierten ihr Wappen oder auch nur das Wappenschild - manchmal auch vergrößert - direkt auf das Flaggentuch. Schon in den 40-er Jahre wurde dazu übergegangen die weiße Scheibe zu entfernen und das Wappen direkt zu platzieren oder vergrößert dazustellen. Dieser Umstellungsprozess erfolgte allmählich, nirgendwo gleichzeitig und vollständig. In einigen britischen Besitzungen sind bis heute Flaggen mit der weißen Scheibe in Gebrauch, in anderen nicht mehr und in einigen Gebieten gibt es beide Varianten nebeneinander. Bis 1922 hätte von den Dienststellen der Provinzen offiziell der britische Union Jack, die sogenannte Royal Union Flag, verwendet werden müssen, oder aber (ab 1922 im Prinzip nur noch) die kanadische blaue Dienstflagge, der typische Britische Blue Ensign, mit dem Wappenschild Kanadas im wehenden Ende. Dennoch hatten die Provinzbehörden eigene Siegel und später auch Wappen, die eigenmächtig im wehenden Ende auf der blauen Dienstflagge platziert wurden. Für dieses Verfahren hätte eine Genehmigung der britischen Behörden vorliegen müssen, was jedoch nicht der Fall war, aber toleriert wurde. Privatpersonen hatten den Union Jack zu verwenden und ab 1892 den sog. Red Ensign, die rote Version der kanadischen Flagge mit dem Union Jack in der Oberecke und dem Wappen Kanadas im wehenden Ende. Im Zuge der allmählichen Trennung Kanadas von Großbritannien wurde im Jahre 1965 für Kanada die neue Ahornblattflagge eingeführt und die dem britischen Flaggensystem zugehörenden Blue und Red Ensigns als nationale Symbole abgeschafft. Dieser Trend wurde auch von einigen Provinzen und Territorien übernommen und es wurden auch dort neue Flaggen eingeführt. Bei einigen Provinzen und Territorien hatte dieser Prozess auch schon früher eingesetzt. Allerdings nicht in Ontario und auch nicht in Manitoba. Hier war man nicht mit der Abschaffung der britischen Symbolik auf den Flaggen einverstanden. Beide Provinzen schufen sich eigene Red Ensigns: 1965 Ontario, 1966 Manitoba. Diese Art Flaggen gab es dort vorher nicht, denn als zivile oder Bürgerflagge wurde in diesen Provinzen der kanadische Red Ensign verwendet. Es gab lediglich in Manitoba einen eigenen Blue Ensign, der von Behörden und Dienststellen verwendet wurde. Ein Red Ensign ist normalerweise eine Art von Flagge, die von allen Bürgern verwendet werden darf (eigentlich nur zur See), jedoch werden die Red Ensigns von Ontario und Manitoba (von Ensign-System abweichend) als Provinzflaggen auch von Behörden und Dienststellen verwendet. Die Flaggen dieser Provinzen folgen somit, aus der Historie heraus, britischen Vorgaben. Es gelten: Blau = Pantone 280, Rot = Pantone 186, Gelb = Pantone 116, Grün = Pantone 364.
Es gibt ein reguläres Wappen für Manitoba, mit Postament, Schildhaltern, einer Wappenkrone und dem Motto. Hier dargestellt ist nur der zentrale Teil des Wappens, der Wappenschild. Das Wappenschild von Manitoba zeigt im Schildhaupt das englische Georgskreuz, darunter ein Bison in der Prärie, ein Hinweis auf Manitoba als Prärieprovinz.
1613 · Thomas Button entdeckt die Gegend des heutigen Manitoba
1670 · Karl II., König von England, übergibt große Teile vor allem im Norden des heutigen Manitoba an die Hudson's Bay Company, in den folgenden Jahren Pelzhandel mit den Ureinwohnern, der Süden Manitobas wird von Franzosen durchstreift
1738 · Gründung von Fort Rouge
1822 · die Hudson's Bay Company errichtet anstelle von Fort Rouge das Upper Fort Gary, die entstehende Wohnsiedlung wird Winnipeg genannt
1869 · die Hudson's Bay Company tritt alle ihre Hoheitsrechte an das britische Dominion Kanada ab
1870 · Gründung der Provinz Manitoba, benannt nach dem Manitobasee. Das Wort "Maintoba" ist indianischen Ursprungs und bedeutet "Pfad des großen Geistes", Winnipeg wird Hauptstadt
1912 · Gebietsvergrößerung im Norden durch Anschluss großer Teile des Keewatin-Territoriums
Der Name der Provinz geht auf den Manitoba-See und die Cree-Indianer zurück. Sie nannten den See
manitou-bou, was mit "Pfad des großen Geistes" übersetzt wird.