Die Flagge zeigte fünf abwechselnd rote und weiße Streifen. Wahrscheinlich geht die Gestaltung der Flagge auf das Wappen der Stadt Regensburg zurück, das zwei gekreuzte silberne Schlüssel auf einem roten Schild zeigt.
Das Wappen des Fürstentums Regensburg ist das der Stadt Regensburg. Es zeigt zwei gekreuzte silberne Schlüssel auf Rot. Das Wappen des Hochstifts (Bistums) Regensburg zeigt auf einem roten Schild eine weiße Diagonallinie von links oben nach rechts unten.
1792, 1796, 1800 und 1805 · Invasionen französischer Revolutionstruppen unter Napoléon in das Deutsche Reich, das Deutsche Reich unterliegt und wird von Napoléon territorial umgestaltet
1801 · alle linksrheinischen Gebiete werden an Frankreich abgetreten und von diesem einverleibt
1803 · Reichsdeputationshauptschluss, Umgestaltung der territorialen Gliederung des Deutschen Reiches, geistliche Besitzungen werden enteignet, alte Fürstenterritorien und freie Städte werden enteignet oder aufgehoben und alten oder neuen Fürstentümern übertragen, die Zahl der Gebietskörperschaften des Reiches wird dadurch von 300 auf 60 reduziert – das ehemalige Fürstbistum Regensburg, die ehemalige Freie Reichsstadt Regensburg, die ehemalige Fürstabtei St. Emmeram, die ehemaligen Reichsstifte Obermünster und Niedermünster, und die Gebiete Donaustauf, Wörth und Hohenburg werden zum Fürstentum Regensburg zusammengefasst, und das Fürstentum wird auf den letzten Kurfürst von Mainz und Reichserzkanzler, dem Fürstprimas Karl Theodor von Dalberg, als Landesfürst übertragen, jedoch erhebt Bayern Ansprüche auf das Gebiet
12.07.1806 · Napoléon erzwingt die Gründung des Rheinbundes, ein Zusammenschluss von sechzehn süd- und südwestdeutschen Staaten unter französischem Protektorat, das Fürstentum Regensburg gehört zu den Gründungsmitgliedern, Fürstprimas Karl Theodor von Dalberg tritt sein Amt in Regensburg an
06.08.1806 · Kaiser Franz II. legt die Krone des Heiligen Römischen Reiches Deutscher Nation nieder, das Reich endet
20.04.1809 · österreichische Truppen besetzen die Stadt
23.04.1809 · französische Truppen erobern die Stadt zurück
22.05.1810 · Napoléon übergibt das Fürstentum Regensburg an Bayern, der Fürst von Regensburg wird mit den Gebieten Hanau und Fulda entschädigt, diese werden an das Fürstentum Aschaffenburg angeschlosen und das Großherzogtum Frankfurt gegründet, das Fürstentum Regensburg endet
Der Name "Regensburg" geht auf das im Jahre 179 n.Chr. von Kaiser Marc Aurel gegründete Legionslager "Castra Regina" zurück. Das heißt übersetzt "Lager am Regen". Der Regen ist der Fluss, an dem Regenburg liegt. Die Germanen nannten den Fluss "Regana", die Römer nannten ihn "Reganum" oder "Reganus", im Mittelalter hieß er "Regin".