Die Flagge wurde am 02.07.1992 angenommen, im Format 1:2. Zwischen 1994 und 2003 war das Format der Flagge offiziell auf 2:3 abgeändert gewesen. Die Farbe Weiß steht für Religiosität und Glauben und das friedliche Zusammenleben der Völker des Landes. Blau steht für den Himmel, die Berge, Flüsse und Seen. Die blaue Farbe in der Flagge lässt aber Rückschlüsse auf das Volk der Altaier zu, die früher Bergkalmüken genannt wurden. Die Altaier, die sich selbst Oiraten nennen, gehören zu den Turkvölkern. Viele Mongolische oder auch Turkvölker haben gemeinsame Wurzeln, und als Farbe ihrer Rasse gilt Blau.
1948 · Umbenennung in Autonomer Bezirk Gorno-Altai
25.10.1990 · Gründung der Gorno-Altaiischen ASSR
03.07.1991 · Umbenennung in Gorno-Altaiische SSR
31.12.1991 · die Sowjetunion löst sich auf, die Verfassung der Russischen Sozialistischen Föderativen Sowjetrepublik (RSFSR, Russland), ein ehemaliger Teilstaat der Sowjetunion bleibt vorerst in Kraft
Mai 1992 · Umbenennung in Republik Hochaltai (Gorny Altay)
12.12.1993 · Umbenennung in Republik Altai
25.12.1993 · eine neue Verfassung für Russland (Russische Föderation) tritt in Kraft, das Verhältnis zu den Gliedern der Föderation wird damit neu geregelt
Das Wort "Altai" ist kirgisischen Ursprungs. "Alty Ai" heißt auf Kirgisisch "Sechs Monate". Damit daben die Kirgisen die Reisezeit von Ihren Weidegründen bis zum Altai auf eine ganze Gebirgsregion übertragen.